Reina Aharen, o elevă mică și drăguță, cu o voce liniștită, este destul de proastă în a determina distanța și spațiul personal. Uneori se află la câțiva centimetri de fața ta, iar alteori, la kilometri prea departe! Singurul care încearcă să-i înțeleagă prostiile este Raidou Matsuboshi, care stă lângă ea în clasă. Are o față amenințătoare, dar, în realitate, este un băiat bun, cu o imaginație care poate scăpa uneori.
Aharen-san wa Hakarenai urmărește perechea ciudată pe măsură ce prietenia lor ciudată începe să înflorească când Raidou ridică radiera lui Aharen pentru ea. Ea îi interpretează greșit gestul și acum îi consideră cei mai buni prieteni, arătând cum cele mai simple lucruri se pot dovedi a fi cele mai complicate provocări pentru ei.